「１回目ショートソード取得時」
ショートソード【説明欄】使用可能スキル：①④

「２回目ショートソード取得時」
ショートソード【説明欄】使用可能スキル：③

「３回目ショートソード取得時」
ショートソード【説明欄】使用可能スキル：②③

この3回において、それぞれのショートソードは同一のものですか？
それとも、同じ装備を付け外しし続けて場合、リセットマラソン的に切り替わるようになりますか？
それによって実装方法が異なります。
異なるというのであれば、ユニーク装備プラグインなど、装備の特性をゲーム実行中に切り替えられるプラグインが必要です。

正確に回避行動を取れば 状態異常を完全に回避できることを（プレイヤーは）期待しています。 何をどうやっても100％食らう状態異常って、それもうゲーマーの手から離れていますからね。 難しくてもいいんですが、絶対不可能というは止めて欲しいですね。ゲーマーの心も離れていきます。 状態異常を回避、というのは装備による無効化という印象になりがちですが、確かにプレイヤー側のアクションで防げるというのも一つの形ですね。 モンハンの状態異常の話を見たことがあるのですが、最近の作品に近づくほどプレイヤーの行動で状態異常によるダメージを防げるようになっています。 （爆破粘菌・狂竜症・裂傷など） ソースを忘れたの...

ボスには状態異常が効く方が好きですね。 FF5の低レベル攻略を参考するといいのではないかと思います。 戦闘終了時にすべて解除はあった方がいいですね。 メニュー画面開いて回復するのが手間なので。 状態異常の付加価値を高めるには、使うチャンスを多く作ることだと思います。 私は、すべての状態異常に会心回避率-25を付けて、状態異常の相手にはクリティカルが出やすいようにしています。 私が試そうとした状態異常だと以下のようなものがありました。 ・燃焼 回復魔法の効果が半分になり、毎ターンHPが減少。 ・怒り（名称未定） HPダメージでない特技が封印される。（類似：ポケモンのちょうはつ） ・痛呪 まだ仕様...

仕様によって実装が異なるので、どういった物が必要なのか確認します。
A:30%で毒orマヒが発生するとした場合、30%の成功判定を行った後に毒とマヒのどちらになるか判定を行う
B:30%で毒の判定、これに失敗したらマヒを改めて30%で判定

Aだとポケモンのトライアタックに似たような効果ですね。

プラグインを作ったり使ったり色々ありますが、みなさんはどのソフトで編集していますか？

私はVisual Studio Code+Chromeのデバッガーで起動する構成で編集しています。
元々C++使いだったので、VScodeは手になじみます。
以下の記事に詳細な使い方があって、助かりました。
http://qiita.com/Sanshiro/items/084fb0971942e03db9a4

これはプラグイン書くしかないですが、参考になりそうな情報を少し。

マップが切り替わった場合、読み込み完了後にScene_Map.start()が呼び出されます。
この処理の時点で$gameMap._eventsで、現在のマップのイベント全てが取得できます。
あとは、これらのイベントに対して.meta[タグ名]でデータを取得して判定をすれば作成できると思います。
セルフスイッチの操作は、ネットにサンプルがあります。

トリアコンタンさんの、スキル副作用プラグインで可能です。

https://raw.githubusercontent.com/triacontane/RPGMakerMV/master/SideEffectSkill.js

http://tm.lucky-duet.com/viewtopic.php?f=23&t=2157-

おそらく既存のカウンタープラグインの応用で作れるのではないかと思います。

雷魔法の例で考えれば
１．反撃を発生させるステートを用意。
２．１のステートを発生させるスキルを作成。
３．反撃専用のスキルを作成。
ダメージ計算内部では、$gameActor.actors(魔法使いの番号).matを参照する。

攻撃の前後や、キャンセルについてはカウンター用プラグインの挙動次第ですね。
併存不可は、ステートの重ね掛け設定でコントロールできると思います。

ツクールMVのプロジェクトをgitで管理しながら動かしているのですが、
gitの除外ファイル設定である.gitignoreをどう設定するかがうまく判断できません。
save/でセーブデータを除外するのはわかりますが、data/やimg/は管理対象にするべきなのかどうか。
他の方はどのような設定しにしているのでしょうか？

使い方の説明を追加してgithubにアップしました。
https://raw.githubusercontent.com/Sigureya/RPGmakerMV/master/Manosasayaki_CriticalHook.js