それは前作のVXAceまでのスクリプトです。
MVなら Graphics.frameCount = 0 でリセットできます。

スクリプトでは対応しきれそうにないので、プラグインを作りました。

ついこの間ツイートしたばかりのタイムリーなネタｗ

$dataItems.forEach(function(item){$gameParty.gainItem(item,1)})

上記スクリプトで、全アイテムが1つずつ増えます。
武器は$dataWeapons、防具は$dataArmorsで。

実行中のイベントIDは「this._eventId」で取得できます。
なお、コモンイベントでこれを参照した場合、「コモンイベントを呼び出したイベントのID」になりますのでご注意ください。
また、イベントから呼び出す以外の方法で実行したコモンイベントから参照した場合にどうなるかはわかりません。

調べてみました。 どうやらBattleManager.updateActionメソッドは1回の実行につき1体分の処理しか想定しておらず、 invokeNormalActionとinvokeCounterAttackを同時に実行してしまうと ダメージ表示対象が上書きされたりHPダメージがリセットされてしまったりするようです。 そこで、カウンター発生時はupdateActionを2回実行するようにし、 1回目はinvokeNormalAction、2回目はinvokeCounterAttackを実行するようにしてみました。 BattleManager.updateAction = function...

こんな感じで。

プラグインでどうこうできることではありません。
どうしても増やしたいなら、CommonEvents.jsonをサクラエディタなどのテキストエディタ（Windows標準のメモ帳はオススメしません）で開き、
コモンイベントデータの行を増やしてidを書き換えてください。

スクリプトでやるなら、以下のようになります。
#ff0000の部分が色です。色の指定方法がわからない場合は、
http://www.colordic.org/
こことか参考にしてください。

プラグインをすべてOFF（もしくは新規作成したばかりのプロジェクト）でも、歩いて解除されますか？

魔法のダメージなら魔法力を低く設定するか、ダメージ計算式次第でどうにかできそうですが、
それでは対応できない感じですか？