無事に解決しました。
make_apk.pyの中にあるversioncodeを1から2に変更したところ、無事にバージョンコードの変更が出来ました。

apkファイルをビルドしたのですが、バージョンアップをしたくてやろうとしたところ。
「バージョン コード 1 の APK が既に存在するため、別のバージョン コードを使用する必要があります。」となります。
manifest.jsonファイルの中でバージョンを1.0.2等変更しても同じエラーメッセージが出てきます。
どのようにビルドしたらバージョンアップできるようになりますか？

先日、RPGツクールmvを購入しました。
いろいろとわからない点が出てきのでこちらに登録させていただきました。
よろしくお願いします。